شن الشيخ الدكتور يوسف القرضاوي رئيس الاتحاد العالمي لعلماء المسلمين هجوما حادا ، على شيخ الأزهر أحمد الطيب من خلال توجيه رسالة عبر موقعه الرسمي اعتمدت على لغة شديدة اللهجة ، و كال فيها القرضاوي للطيب العديد من التهم ، من قبيل أنه من أوحى الى قادة الانقلاب " لقد كنتُ أظنهم قد غرروا بك، فعلمتُ بقولك أنك ممن أوحى لهم " و بأنه متورط مع الذين خططوا لما حدث و يحدث في مصر " وكنت أحسبك متورطا، فعلمت أنك متآمر " كما قال بأن الطيب مشارك في هذه المؤامرة و ليس مجبرا عليها " وكنت أخالُك خائفا، فعلمت أنك مشارك " .
و وصل الهجوم حدته من خلال اتهام القرضاوي للطيب باستغلال منصبه كشيخ للأزهر من أجل قضاء مصالحه الخاصة حيث خاطبه قائلا : " تكيد لهذه الأمة وتمكر بها، وتتخذ من عمامة الأزهر غطاء لمآربك، وتمويها على المصريين!!" " .
و شكلت الرسالة الموجهة للطيب رسالة اتهام اكثر منها رسالة عتاب حيث انتقل القرضاوي الى الهجوم بشكل قوي مذكرا بأن انصار مرسي على حق و بأن الطيب يغض الطرف عن الحق و ينصر الباطل .